Theo hãng thông tấn Kyodo, một trận động đất với cường độ 6,6 độ richter làm rung chuyển vùng Tây Nam Nhật Bản vào 21:19 ngày 13/1. Tâm chấn ở độ sâu khoảng 36 km ngoài khởi biển Hyuga Nada, tỉnh Miyazaki. Ở nhiều khu vực rộng lớn phía Tây cũng cảm nhận được rung lắc.
Cường độ trận động đất đã được điều chỉnh hai lần. Ước tính ban đầu là 6,4 độ richter, sau đó điều chỉnh thành 6,9, cuối cùng được cập nhật là 6,6 độ richter.
Theo Cơ quan Khí tượng Nhật Bản, sau động đất, đã có sóng thần nhỏ ở một số khu vực tỉnh Miyazaki và Kochi. Cơn sóng thần cao khoảng 20 cm ở một số khu vực của Miyazaki. Còn tại Kochi, sóng thần cao 10 cm. Hiện cảnh báo về sóng thần đã được dỡ bỏ.

Mặc dù tâm chấn xảy ra bên dưới rìa phía Tây của tâm chấn trận động đất Rãnh Nankai, nhưng “trận động đất này không được coi là làm tăng nguy cơ xảy ra động đất rãnh Nankai”, cơ quan này nhận định.
Ngay sau khi có cảnh báo động đất, đã có báo cáo rằng không có bất thường nào được phát hiện tại nhà máy điện hạt nhân Ikata ở tỉnh Ehime và nhà máy điện hạt nhân Sendai ở tỉnh Kagoshima. Một số tuyến tàu cao tốc Kyushu Shinkansen đã tạm thời dừng hoạt động. Hiện chưa có báo cáo về thương vong hay thiệt hại.